Webpar-clip法によるサンプル調整 図1に、par-clip法の流れを示します。実験ステップが多いの で、rnaを失ったり、分解してしまわないように細心の注意を払う 必要があります。はじめに、細胞を回収する前夜に、培養液中に4- チオウリジン (4-su)を添加し、これを ... PAR-CLIP (photoactivatable ribonucleoside-enhanced crosslinking and immunoprecipitation) is a biochemical method for identifying the binding sites of cellular RNA-binding proteins (RBPs) and microRNA-containing ribonucleoprotein complexes (miRNPs). The method relies on … See more • CLIP-Seq, a similar method for identifying the binding sites of cellular RNA-binding proteins (RBPs) or RNA modification sites using UV light to cross-link RNA to RBPs without the incorporation of photoactivatable … See more • starBase database: decoding miRNA-mRNA, miRNA-lncRNA, miRNA-sncRNA, miRNA-circRNA, miRNA-pseudogene, protein-lncRNA, … See more
三分钟看懂RNA互作蛋白方法 - 知乎 - 知乎专栏
WebJul 2, 2010 · The protocol below describes the PAR-CliP procedure for HEK293 cells expressing FLAG/HA-tagged IGF2BP1 upon induction with doxycycline. We will use an … WebAtaxin-2が特定のモチーフを認識して結合しているのかどうか解析した.PAR-CLIP法ではRNA結合タンパク質の結合部位にチミンからシトシンへの置換が挿入されるため,この情報をもとに解析した.その結果,Ataxin-2はウリジンに富んだ配列を認識していることがわかった( 図1 ).そのなかには,AUUUAを基本骨格としmRNAの安定性を制御す … do footnotes require a bibliography
PAR-CLIP (Photoactivatable Ribonucleoside-Enhanced Crosslinking and Immunoprecipitation): a step-by-step protocol to the transcriptome-wide identificatio…
WebPromega – プロメガ株式会社 WebAug 18, 2011 · PAR-CLIP (photoactivatable-ribonucleoside-enhanced crosslinking and immunoprecipitation) is a powerful modification of the CLIP technology for the isolation of protein-bound RNA segments [ 7 ]. Cells are first cultured with a photoreactive ribonucleoside analogue, typically 4-thiouridine (4SU), to boost RNA-protein crosslinking. do foot notes get a new page